رئيس جمهور سابق پاکستان ضمن رد هرگونه مشارکت در ماجراي ترور بوتو اعلام کرد اين پرونده با انگيزه هاي سياسي تنظيم شده است.دادگاه ضد تروريسم پاکستان مشرف را مجرم خواند و بعد از قصور وي در همکاري با بازپرسان تحقيق پرونده ترور بوتو حکم بازداشت وي را صادر کرد.
بعد از درخواست بازپرسان اين پرونده از دادگاه براي احضار مشرف به سبب قصور در تامين امنيت کافي براي بوتو، اين دادگاه در فوريه سال 2011 کيفرخواستي را عليه وي صادر کرد.مشرف فعلا به قيد ضمانت آزاد است.