در موزه سنگ نگاره‌های مراغه انواع سنگ قبر ، کتیبه‌های سنگی و قوچ‌های سنگی نفیس مربوط به دوره‌های قبل و بعد از اسلام به نمایش درآمده است.

بیشترین آثار سنگی این موزه  سنگ قبر‌های صندوقی است که روی آنها با اشکال هندسی زیبا و آیات قرآنی تزئین شده است.

در برخی از این سنگ قبر‌ها ابزار آلات و وسایل شغلی، موقعیت اجتماعی شخص مرده در زمان زندگی اش به صورت هنرمندانه حجاری شده است.

از آثار با ارزش این موزه سنگ صلوات است که در محل ورودی نصب شده و نام پیامبر و ۱۴ معصوم بر روی آن حجاری شده و کسانی که بخواهند از زیر آن رد شوند باید به محمد و آل محمد صلوات بفرستند.