آیین معنوی اعتکاف در مسجد قدس با حضور معتکفین و در آخرین روز خود در حال برگزاری می باشد. در این سه روز، معتکفین با روزه گرفتن و ماندن در مسجد، به عبادت و تزکیه نفس می‎پردازند.