پیکر آیت الله بجنوردی بعد از تشییع در صحن کوثر حرم مطهر رضوی و اقامه نمازتشییع و خاکسپاری در حرم رضوی توسط آیت الله اشرفی شاهرودی در رواق دارالزهد بارگاه ملکوتی حضرت رضا علیه السلام به خاک سپرده شد.

آیت الله حاج سید مهدی موسوی بجنوردی، همزمان با سالروز شهادت حضرت علی (ع)، در تهران تشییع و سپس برای خاکسپاری به مشهد منتقل شد.
مرحوم آیت الله حاج سید محمدمهدی بجنوردی از شاگردان آیات عظام سید محسن حکیم، سید محمود شاهرودی، میرزا حسن بجنوردی و شیخ حسین حلی در نجف اشرف بود که روز پنجشنبه در سن ۸۸ سالگی در تهران دارفانی را وداع گفت.

«تحریر الأصول»، «کتاب الطهارة» و «کتاب البیع» از آثار منتشر شده آیت الله بجنوردی است.