مسجد گنجعلی‌خان، در ضلع شمال شرقی میدان گنجعلی‌خان و در کنار مدرسه گنجعلی خان واقع‌شده است. قدمت این مسجد به حدود سال ۱۰۰۷ هجری قمری و دوره صفویه بازمی‌گردد که توسط گنجعلی‌خان حاکم منصوب شاه عباس صفوی ساخته‌شده است. مسجد گنجعلی‌خان محل عبادت حاکم کرمان بوده است. این بنا موزه‌ای از هنرهای تزیینی گچ‌بری، حجاری، خطاطی، درودگری و خط نوشته‌های شهاب‌الدین کرمانی و علیرضا عباسی است.