ولایتی رئیس هیئت موسس و امنای دانشگاه آزاد اسلامی در پیامی به آیت‌الله سیدمحمود هاشمی شاهرودی، انتصاب وی از سوی مقام به ریاست مجمع تشخیص مصلحت نظام را تبریک گفت .
فرمانده سپاه در دوران دفاع مقدس با اشاره به انتصاب سرلشکر باقری به ریاست ستادکل نیروهای مسلح، یادآورشد که وی کارنامه‌ای درخشان در مسئولیت اطلاعات جنگ از خود به جای گذاشت و امتحان خوبی را در دوران دفاع مقدس پس داد.